ジャンルはクォータービューのアクションアドベンチャー。
映画「秘密の部屋」をベースにしたストーリー構成。
ホグワーツ、禁じられた森、ダイアゴン横丁などを忠実に再現。
前作（賢者の石）よりグラフィックが大幅に向上。
使用可能な呪文が大幅に増加し、種類も豊富。
魔法はオブジェクト浮遊・攻撃・障害物除去などに使える。
呪文の使用制限はなく、MP消費などは存在しない。
魔法アイテムやカード収集といったコレクション要素も搭載。
チョコカエルを5個集めるごとにライフの上限が1増加。
ライフが0になると、そのエリアの最初からやり直し。
ステージ攻略型で、各部屋ごとにアイテム収集が目的。
セーブは決まったポイントでのみ可能。
セーブデータは1つのみで、途中セーブの自由度は低め。
イベント後は毎回8階の談話室に戻される仕様。
ホグワーツ校内の移動が多く、徒歩が基本でテンポが悪い。
肖像画によるワープはあるが、それでも煩雑。
使用呪文の切り替えはメニュー画面からのみで操作性が悪い。
ゲーム全体のテンポがやや遅く、作業感を強く感じる。
ダンジョンの謎解きに工夫が少なく、単調な展開が多い。
イベントシーンのいくつかはテキスト説明だけで処理される。
ハリーとロンの空飛ぶ車のシーンなどもムービーなしの文章のみ。
GBA版とGC版を接続すると隠し要素が解放される特典あり。
クィディッチ要素は前作より面白く、練習モードも搭載。
原作の大筋には比較的忠実な構成（アズカバンよりは再現度高め）。
GBA作品としては画面の明るさ調整ができ視認性も良好。
ファン向けにはある程度満足できるがテンポ重視の人には不向き。
プレイ時間は5〜6時間程度とやや短め。
ミセス・ノリスなどの細かいキャラ描写もあり世界観の再現は高評価。
作業感と頻繁な移動で疲れやすく、集中して一気に進めるのが推奨。
総じて「原作愛はあるがプレイ感に難あり」のファン向けタイトル。