シリーズ最大級のボリューム：収録作品数・機体数が圧倒的に多い（ユニット総数1059体）。
初の4枚組構成：本編3枚+プレミアムディスク1枚。
「マルチシチュエーションモード」搭載：任意の作品から自由にスタート可能。
オリジナルキャラが64人登場：シリーズで定番化したキャラも多数登場。
『クロスボーン』『閃ハサ』など非アニメ作品も完全シナリオ収録。
『センチネル』『ブルーディスティニー』などマニアックな原作も参戦。
騎士ガンダム・武者ターンエーなど異色枠もあり。
ゲームオリジナルMSの完成度が高く他作品に登場例あり。
「サイコ・ハロ」などギャグ系最強機体が登場。
タイトルコール演出導入：原作BGMと声優で盛り上げる演出。
「支援攻撃」など新システム追加。
「黒歴史コード」による外部商品との連動要素。
ガンダムファイトモード搭載：育てたMSでバトルロイヤル。
バランスブレイカーが複数存在（例：リフレクターインコム）。
全体的な難易度は低めで育成要素が強調された作風。
育成でどんな機体も強くなる反面、ゲームバランスは崩壊気味。
「ボーナスステップ」で連続行動可能、無双状態に陥りやすい。
武装ごとの性能差が大きく、格闘・連装ミサイルが特に強力。
オリキャラが原作キャラより圧倒的に強く優遇されている。
原作キャラはレンタル制、育成の恩恵が受けにくい。
原作再現度にばらつきあり。『∀』は1ステージのみ。
一部シナリオに原作改変が見られる（例：EW最終戦など）。
ディスク入れ替え仕様がやや不便（Disc1がキーディスク）。
音質や戦闘アニメにムラあり：ZERO以前の流用も多い。
バグや設定ミスがいくつか存在（例：白トーラス無限キャピタルバグ）。
セーブデータが大きい（中断セーブ7ブロック）。
一部後継機が弱体化してしまう仕様も（例：サンドロックC）。
MP消費タイミング変更により、超強気状態の敵が極端に強化される。
戦闘アニメにミスもある（例：Xのサテライトキャノン誤展開）。
シリーズの基盤を築いた名作であり、今なお根強い人気を誇る。