前作のキャラ数32人から42人に増加
ストーリーはナルトとサスケの再会、「暁」との戦いを描く
飛段・角都を主役にした「暁サイドストーリー」も収録
新モード「巨獣大戦」「協力巨獣大戦」を追加
各キャラに奥義が2種類設定されている
ナルトは「風遁・螺旋手裏剣」がゲーム初登場
タッチパネルで使用する21種類のアイテムが登場
バトル中は「弱攻撃」「強攻撃」「回避」「奥義」などを駆使
チャクラゲージ制で奥義・回避に消費（溜まりやすい）
DSながらキャラボイスあり（音質は悪いとの声も）
グラフィックはDSにしては健闘しており、キャラは滑らか
巨獣とのバトルは単調でテンポが悪いとの不満が多い
技のバリエーションが少なく、キャラごとの差別化に欠ける
コンボの仕組みが単調で、どのキャラでも同じ操作感になりがち
サバイバルモードは100人撃破だが後半は作業感が強い
ストーリーモードは全10話と短く、フィールド移動も単調
戦闘内容に関わらず台詞が固定されるなど没入感が弱い
オプション設定が非常に少なく、音量や演出設定が不可
奥義演出は迫力ありだが、ダメージ量は低め
対COM戦は戦術がワンパターンになりやすく飽きやすい
対戦プレイでは盛り上がる可能性あり（通信プレイ前提）
評価は「DSにしては頑張ってるが粗が多い」
ナルトファンには一定の満足度あり
原作未読だとストーリーは理解しづらい構成
オリジナル要素や表情演出が少なく淡白という意見も
過去作からの使い回し感があり目新しさに欠けるという声もあり
DSナルト系の中では“最もキャラ数が多い”点が評価されている